一. 实验的目的和要求:
生物信息学是农学专业的一门主要专业基础课。本课程实践性很强,通过对生物信息学方面的大型数据库及其利用、常用的分子生物学数据的分析方法的讲授,培养学生分析问题、解决问题的能力,对于提高学生专业课程学习的兴趣和解决实际问题的能力具有重要意义。在实验教学中,要求学生结合课堂教学,通过动手操作,对模拟数据进行分析,可以加强学生对生物信息学的基本原理及其在植物科学与技术的利用有进一步认识,为专业课程的学习奠定深厚的理论基础。
二. 实验条件:
完成本课程实验至少需要10学时,并需要网络教室(能高速上网的计算机等),生物信息学主要的计算机软件及数据库等,由于本课程发展迅速,在教学过程中要不断更新实验内容,以适应学科发展需要。
三. 实验材料:
实验所用数据主要从相关数据库下载。
四. 实验课主要内容:
序号 |
实验项目 |
学时 |
实验类别(综合实验) |
试验类型 (上机) |
实验内容 |
具体要求 |
1 |
生物学数据库 |
2 |
综合实验 |
上机 |
生物学数据库的了解与认识 |
了解常用生物学数据库的类型及结构 |
2 |
数据库利用 |
2 |
综合实验 |
上机 |
分子生物学数据库的搜索与利用 |
掌握数据库查询与搜索的方法与技巧 |
3 |
DNA序列分析 |
2 |
综合实验 |
上机 |
DNA序列的初步分析 |
掌握常用DNA序列分析的方法 |
4 |
EST与蛋白质序列分析 |
2 |
综合实验 |
上机 |
EST与蛋白质序列的初步分析 |
植物常用EST和蛋白质分析的方法 |
5 |
生物信息学综合实习 |
2 |
综合实验 |
上机 |
综合应用生物信息学方法进行数据分析 |
对生物信息学常见各种数据的分析有整体了解 |
6 |
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7 |
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